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《自然》发布重要单细胞RNA图谱:首张小肠细胞图谱

Update:2017-11-15From:生物通 Hot:
  

 我们肠道上皮是人体内多样性最高,最具活力的组织之一, 作为机体与外界的主要界面之一,组成了一个细胞的生态系统。为了更好地理解这些复杂的组织及其功能,还有影响它的疾病,麻省理工学院、哈佛大学和麻省总医院研究人员领导的一个研究团队通过分析从小鼠肠道或肠道类器官中取样的5.3万多个单独的细胞,完成了一张高分辨率、以构成小肠的细胞基因表达为基础的细胞图谱。这为研究影响肠道疾病的各种生物学条件提供参考, 如炎症性肠病、小肠癌、乳糜泻(celiac disease)和食物过敏,也增强了我们对肠道细胞产生激素和其他信号的理解, 并为肠道如何对不同入侵病原菌做出应答提供了新的线索。 

这一重要成果公布在11月8日的Nature杂志上,由麻省总医院Aviv Regev领导完成,此前Regev还曾与张锋一道,报道了新测序技术Div-Seq的最新成果。

肠道执行的功能很多, 包括吸收养分, 产生身体的许多激素, 并拒绝有毒物质和病原体的入侵。为此, 它需要依赖于许多特殊细胞的活性和互动。其中一些细胞是我们所知的, 但迄今仍有不解之谜。

在这篇文章中,研究人员通过大量的单细胞转录组RNA测序 (scRNA-seq)揭示了之前未知的细胞亚型,并详细说明了细菌和病原体入侵感染时,小肠上皮发生的变化。scRNA-seq是一套有效的基因组技术, 能够识别个体细胞内的特定基因表达谱。

Aviv Regev表示,“每一个新技术都是更详细的研究细胞和组织的一个新机会, 这能帮助我们提出新的生物学问题, 或重新审视旧的问题。”

“我们希望利用单细胞RNA测序技术,在更深层次里了解什么是正常的肠道组织。有了这个基线, 我们就可以开始分析疾病了。”

文章的另外一位作者,博士后 Moshe Biton说,“肠道上皮与免疫系统,以及肠道微生物都有联系, 因此肠道是细胞连接的主要中枢, 对我们来说了解健康和疾病的肠道生理是非常重要的。而且这也是一个我们研究多时的组织,我们对其的了解不少,现在我们需要重新审视它, 看看我们是否可以通过scRNA-seq找到新的东西。”

原文标题:

A single-cell survey of the small intestinal epithelium

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