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特殊组织DNA的提取及鉴定

From:绿谷生物网 Updated:2007-08-10
1、提取DNA的简易方法:
1)、从全血中提取DNA:取20μl抗凝血于0.5ml无菌管中,加500μl左右的ddH2O混匀后,12000rpm离心2分钟,弃上清,(若沉淀中仍 有红细胞,需重复此操作1-2次)加入样品提取液20μl,混匀,100℃煮10分钟(可在扩增仪上进行)后12000rpm离心5分钟,取上清2μl进行扩增。
2)、从其它有核细胞中提取DNA:可直接加适量的样品提取液到装有发根、头屑、骨髓、精子、组织碎片等有核细胞的管中,100℃煮10分钟(可在扩增仪上进行)后12000rpm离心5分钟,取上清进行扩增。
2、从全血中用有机溶剂提取DNA:
1)试剂
a.10%SDS
b.2.0M醋酸钠
c.20mg/ml蛋白酶K
d.苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)   
e.分析纯乙醇
f.TE(10mM Tris,1.0mMEDTA溶液,Ph7.5)
2)步骤
A、血液样本收集于含EDTA的抽血用管子中,样品用手倒转试管混合后等分。每份700μl全血可放在1.5ml的塑料离心管中,-70℃储存。
B、在解冻的(或液体的)血液中加入800μl的TE并混匀,12000rpm离心2分钟。   
C、吸取1.0ml上清液并弃去。
D、加入1.0mlTE,振荡后离心2分钟,去除尽可能多的上清液,但不要影响沉淀。
E、向沉淀中加入:375μl 2M醋酸钠; 25μl 10%SDS;5μl 蛋白酶K溶液。略加振荡,于56℃保温一小时。
F、加入120μl苯酚/氯仿/异戊醇,振荡30秒。
G、12000rpm离心5分钟。
H、小心移出水相(上层)到一新的1.5ml的离心管中。
I、向水相中加入2.5倍体积预冷的分析纯乙醇,倒转试管加以混合,将试管于-20℃下放置10分钟以上。
J、12000rpm离心10分钟。
K、倾去酒精,用移液器小心吸去剩余酒精,不要触动沉淀。
L、加180μl TE 后振荡。加20μl2M醋酸盐,手工混匀。
M、加500μl预冷分析纯酒精,用手轻轻混匀,12000rpm离心10分钟,倾去上清液。
N、用室温下的70%酒精1ml洗涤DNA沉淀,12000rpm离心5分钟,倾去上清液
O、用移液器吸去残余的酒精,管子置于真空离心抽除残余的酒精(大约10分钟)。或将管子放在100℃以下烘干。
P、加200μl TE于DNA沉淀中,混匀后于4℃保温过夜(或56℃溶解DNA 2小时以上),次日清晨振荡10秒。
3、从斑痕材料中用有机溶剂提取DNA   
1)试剂
a.斑痕抽提缓冲液(1.21g Tris,5.84gNaCl,6.02g二硫苏糖醇,   2%SDS,10mMEDTA/升,Ph8.0)
b.其它试剂见2.1)   
2)步骤
A、将斑痕剪成碎片后置于1.5ml的塑料离心管中。   
B、加400μl斑痕抽提缓冲液及10μl蛋白酶K溶液,混匀,离心数秒使碎片浸入液体。
C、于56℃保温过夜。
D、用一新的灭菌牙签将碎片中的液体拧干后从管中取出。
E、加500μl苯酚/氯仿/异戊醇,手摇混匀,12000rpm离心3钟。
F、将上清液转移到新的离心管。
G、上清液中加入2.5倍体积预冷的分析纯酒精。
H、手摇混匀试管中的各种成分,放置-20℃10分钟以上。
I、12000rpm离心10分钟。
J、倾去酒精。
K、用1ml室温的70%酒精洗涤。
L、12000rpm离心5分钟。
M、倾去酒精,用移液器吸去残余酒精。
N、真空离心10分钟除去残余酒精,或在100℃以下烘干.   
O、56℃下用36μl TE溶解DNA,时间至少2小时。   
4、从精斑中分离提取DNA   
1)试剂   
a.TNE缓冲液(1.21g Tris,5.84gNaCl,0.37gEDTA/升)
b.20%sarcosyl
c.0.39M二硫苏糖醇   
d.其它试剂见2.1)
2)步骤
A、从棉签上取下有检材的棉花并置于1.5ml塑料离心管中。
B、管中加入400μl TNE缓冲液;25μl 20%sarcosyl;75μl水;5μl蛋白酶K溶液。手摇混匀,37保温2小时。   
C、用一新的灭菌牙签将棉花拧干后从管中取出,再用12000rpm离心5分钟。
D、移上清液(内含裂解细胞或"雌性"片段)于一新的1.5ml管,不要振荡沉淀物(内含非裂解细胞或精子)。再用TNE洗脱沉淀物四次。
E、在有沉淀的管中加入10μlTNE;50μl20%sacrosyl;40μlDTT;150μl水;10μl蛋白酶K溶液。手摇混匀,37℃保温2小时。
F、按3,2)E~O的方法分别抽提出两管中的雌性DNA和精子DNA。
5、用Chelex从全血/血斑中抽提DNA
1)试剂
a.TE
b. 5%Chelex 100(w/v于无菌水中)
2)步骤
A、3μl全血或3mm×3mm的血斑置于灭菌的1.5ml离心管中,加入灭菌的1mlTE于管中,振荡数秒。
B、置于室温30分钟,振荡数秒。   
C、用12000rpm离心3分钟。   
D、弃上清液,保留足够上清液盖没沉淀,勿搅起沉淀。
E、加入200μl 5%Chelex,振荡数秒。
F、于56℃保温30分钟。
G、振荡数秒。 
H、沸水浴8分钟。
I、振荡数秒。
J、用12000rpm离心5分钟,上清中为提取的DNA。
6、用Chelex从精斑中抽提DNA   
1)试剂
a.TE ,
b.10mg/ml蛋白酶K
c.20% Chelex100(w/v于无菌水中)
d.洗脱缓冲液(10mM Tris,10mM EDTA,50mMNaCl,2%SDS,Ph7.5)
e.1M二硫苏糖醇
2)步骤 5m
A、将附有检材的棉签或纤维置于1.5ml灭菌离心管中,加1ml灭菌的TE,振荡数秒。
B、室温30分钟。
C、振荡数秒。   
D、用一新的灭菌牙签将残片拧干后从管中取出。
E、用12000rpm离心3分钟。
F、弃去上清液,但保留约50μl上清液,勿使"细胞沉淀"搅起(若沉淀体积较大,应保留更多上清液,在此例中,保留的上清液体积应为沉淀的2倍)。
G、加150μl灭菌的蒸馏去离子水和2μl蛋白酶K溶液。
H、56℃保温1小时以裂解非精子细胞。
I、用12000rpm离心5分钟,沉淀为"精子沉淀"。   
J、取150μl上清液(含裂解细胞组分)及到一新的1.5ml离心管中,再加50μl 20%Chelex,振荡数秒后,稍加离心,然后接步骤O~S进行操作。
K、用0.5ml洗脱缓冲液重新悬浮原管中的沉淀,略加振荡, 用12000rpm 离心5分钟,弃去约450μl上清液。   
L、重复步骤K再洗四次。
M、用1ml灭菌的蒸馏去离子水重新悬浮沉淀,稍经振荡,用12000rpm离   心5分钟,弃去950μl上清液。   
N、加150μl的5%Chelex,2μl蛋白酶K溶液,7μl 1M的二硫苏糖醇   于"精子组分",振荡数后,稍加离心。
O、56℃保温1小时。
P、振荡各管数秒。
Q、样品于沸水浴8分钟。   
R、振荡数秒。
S、用12000rpm离心3分钟,两管的上清中分别含有非精子细胞DNA和精子细胞DNA。
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