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DNA及RNA含量测定

From:绿谷生物网 Updated:2007-12-20
一、光密度测定法

  [原理]

  DNARNA260nm处有一很高的吸收峰,利用这个原理我们测其OD260,再推算出其浓度。

    [仪器]

    分光光度计(紫外可见光两用)

    [试剂]

    水,DNARNA溶液。

    [操作]

    (1)5ulDNA样品或4ulRNA样品加水到lml

    (2)lml水做空白。

    (3)把样品杯放在分光光度计比色槽上。

    (4)ulDNARNA浓度(ug)将是OD值的10倍,例如稀释后样品在260nmOD值为0.2,则原DNARNA样品浓度为2ugul

    (5)如果想要检测样品的纯度,那么还要再测一次280nmOD值,计算二者的比率,若比率接近2,则说明样品中核酸比较纯。若比率小于1.6,则说明蛋白或其它吸收此波长的杂质在其中,建议再用酚/氯仿抽提继以乙醇沉淀以除去杂质。

    (6)如果想检测样品中是否残存酚等有机杂质,那么还要测定一次230nmOD值。

    二、琼脂糖电泳测量法

    [原理]

    质粒DNA及微量DNA片段的浓度可与已知浓度的DNA同时进行电泳,根据结合的溴化乙锭荧光强度,估计其含量。

    [仪器]

    紫外透射反射分析仪(上海康华生化仪器制造厂);电泳槽;电泳梳;电泳仪。

    [试剂]

    6×上样缓冲液:0.25%溴酚蓝;40(WV)糖。

    10×TBE电泳缓冲液:0.89mol/LTris-硼酸;0.02molLEDTANa2pH8.3

    0.8%琼脂糖:0.8%琼脂糖;100mi 1×TBE

    5mgmlEB0.5gEB100ml三蒸水

    [操作]

    (1)1×TBE电泳缓冲液0.8%琼脂糖凝胶,加溴化乙锭其终浓度为0.5ugm1

    (2)加热使琼脂糖熔化均匀,取出室温冷却至50-60℃。

    (3)取一块5×7cm玻璃板,置水平台上,放一微型点样梳,点样梳底部离玻璃平板的距离为0.5-1. 0mm

    (4)将凝胶小心倒在玻璃板上,待冷却后取出点样梳,保持点样孔的完好。

    (5)DNA样品及),DNA标准浓度各lul加入1×TBE4ul,加入上样缓冲液lul,混

  匀。

    (6)0.8%琼脂糖凝胶点样孔小心点样,记录样品点样次数与点样量。

    (7)打开电源开关,电压不超过5Vcm,一般40V30-40分钟。   

    (8)取出泳动后的凝胶板,翻转玻璃盖在紫外分析仪观察DNA区带。

    (9)DNA含量的估计:比较待测DNA的条带与已知DNA的各条带的荧光密度,估计待测DNA在凝胶中的含量,再估计出其浓度。

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