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一些其它的cDNA合成技术介绍

From:绿谷生物网 Updated:2007-12-20
       除Riboclone M-MLV(H-)cDNA合成技术外,Promega公司还提供有多个AMV合成试剂盒,不同试剂盒所提供的引物或引物一延接头(Primpr-Adaptor)不同,有oligo(dT)15 引物、随机引物、XbaⅠ引物-延接头、NotⅠ引物-延接头等,其余试剂一样,这些系统包括:
  20mg 引物
  20ml 5×第一链缓冲液, 配方如下:
  250mmol/L Tris·Cl,pH8.3(42℃);250mmol/L KCl;50mmol/L
  MgCl2; 2.5mmol/L 亚精胺(Spermidine); 50mmol/L DTT;
  20mmol/L dATP, dCTP,dGTP,dTTP(各5mmol/L)。
  50ml 40mM焦碳酸钠
  625m rRNasin RNA酶抑制剂
  600m AMV反转录酶
  5mg 1.2kb对照RNA
  200ml 10×第二链缓冲液,配方如下:
  400mmol/L Tris·Cl,pH7.2; 900mmol/L KCl; 30mmol/L
  MgCl2; 30mmol/L DTT; 0.5mg/ml BSA。
  2m E.Coli RNaseH
  500m E.ColiDNA PolymeraseⅠ
  100m T4 DNA PolymeraseⅠ
  1.5ml 不含核酸酶的水
  以上所有试剂除对照RNA需在-70℃保存外,其余均可保存于-20℃,可以合成40mgmRNA。

  (一)第一链合成
  下面介绍的是25ml体积反应系统,该系统可合成多至2mgmRNA,每增加1mg mRNA,需增加反应体积10ml,如5mg mRNA需55ml反应体积。
  引物或引物-延接头和反转录酶与mRNA的比例应分别保持为0.5mg/mg(对NotⅠ引物-延接头为0.3mg/mg)和15m/mg.
  1、试剂:
  [a-32P]dCTP(>400ci/mmol),EDTA(50mM和200mM),TE饱和酶/氯仿,7.5mM NH4Ac,100%和70%乙醇,TE缓冲液(10mM Tris·Cl,pH8.0,1mm EDTA)。
  2、操作步骤:
  (1)取一灭菌的无RNA酶的eppendorf管加入的RNA样品,及引物或引物-延接头,用H2O调节0.5mg引物/mg mRNA(或0.3mg NotⅠ引物-延接头/mg mRNA)的体积至15ml,70℃加热5分钟,待冷至室温,离心数秒钟使溶液集中在管底,然后依次加入:
    5×第一链缓冲液 5ml
    rRNasinR RNA酶抑制剂 25ml
    40mM焦碳酸钠2.5ml
    AMV反转录酶 15m/mg RNA
    加无水RNA酶水至总体积25ml
  在加入焦碳酸钠和AMV反转录酶前,需将反应液42℃温浴5分钟,以阻止焦碳酸钠沉淀。焦碳酸钠主要用于抑止第一链形成发夹结构。
  (2)轻弹eppendorf管,取出5ml至另一加于2-5m[a-32P]dCTP c>400ci/mmol)(其体积不能超过1ml),用以第一链同位素掺入放射性活性测定。
  (3)42℃温浴1小时。
  (4)取出置冰上。
  (5)掺入测定的eppendorf管加入50mM EDTA,终止反应,并使总体积为100ml。可取90ml进行电泳分析,另10ml进行同位素掺入测定。
  (6)第一链合成离心管可直接用于第二链合成。

  (二)第二链合成
  第二链合成可在第一链合成反应液中直接进行。
  1、第一链反应液(20ml)中依次加入
    10X 第二链缓冲液 10ml
    E.Coli DNA polymeraseⅠ 23m
    E.Coli RNaseH 0.8m
    加无核酸酶水至总体积 100ml
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